Chion-in består av 106 separate bygninger av ulik størrelse. Tempelporten er den største i verden: 24m høy og 50m bred. En buddhastatue befinner seg i den øvre etasjen sammen fargerike malerier av himmelske vesener og flyvende drager. En minneseremoni til ære for Hônen finner sted hvert år i tiden 19-25 april. Der er også mange andre høytider som trekker mange besøkende året rundt. På nyttårsaften ved midnatt, blir det slått 108 slag med tempelklokken. 16 mann svinger en trestokk mot den 74 tonn tunge klokken og lyden høres over hele byen.

I 1201 oppholdt Shinran seg på fjellet Hiei 比叡山 der det var en statue av bodhisattvaen Kannon 観音 som man mente var en inkarnasjon av prins Shôtoku, den politiske lederen som innførte buddhismen til Japan midt på 500-tallet. På den 15.dagen av sitt opphold der, kom prinsen til Shinran i en drøm og ba ham dra på en pilgrimsreise til Chion-in. Der var på denne reisen at Shinran møtte Hônen for første gang og aksepterte den nembutsu-praksis som Hônen hadde lært.

Etter at Hônen hadde levd i eksil en tid utenfor Kyôto, vendte han tilbake til byen i 1211 i en alder av 79 år. Det påfølgende år døde han imidlertid, etter å ha fastet seg selv til døde i det som i dag kalles Seishi-dô-hallen 勢至堂 i Chion-in, og ble gravlagt på tempelområdet. Et bilde av Hônen i denne hallen vises særskilt ære hvert år på Hônens dødsdag. Seishi-dô er for øvrig templets eldste bygning, opprinnelig bygget som et zen-tempel, men omgjort til Jôdô-shû tempel i 1530.
 

I kraft av at det var ved Chion-in at Hônen levde og døde, fikk templet en ledende posisjon innen Hônen-gruppen. Det skjedde likevel ikke uten kamp. Det oppsto bl.a. stridighet mellom Chion-in 知恩院 og Chion-ji 知恩寺 der sistnevnte gjorde krav på betegnelsen 'hovedtempel' (suffiksen -ji 寺 betegner vanligvis et autonomt hovedtempel og -in 院 et undertempel). Striden havnet i retten som dømte til fordel for Chion-in. Det var neppe helt uventet, ettersom noen ti-år tidligere (1443) hadde den ledende abbed ved Chion-in, Keijiku (1403-59), mottatt følgende beskjed fra keiser Hanazono 花園 (r.1428-64): "ettersom ditt tempel er av høyeste rang innen hele Jôdô-gruppen, er du berettighet til å bære offisiell drakt og ha tilgang til hoffet". Dette keiserlige edikt kunne en selvsagt ikke se bort ifra, og og fra begynnelsen av det 16. århundret var templets ledende posisjon ubestridt innen Jôdô-shû 浄土宗, Den Rene Land-buddhismen.

Et hovedtempel har selvsagt også mange kulturskatter. Noen av disse befinner seg i dag ved Kyôto nasjonale museum. Her oppbevares bl.a. et berømt bilde (scroll) fra 1200-tallet som kommer fra Chion-in. Det viser Amida Buddha omgitt av 25 bodhisattvaer som kommer ned til jorden for å motta sjelene til de som dør i troen på ham. (Se: Haya Raigo). En annen kunstskatt fra Chion-in templet, er en bildefremstilling av Hônens liv, skrifter og ideer i 48 deler, kalt Hônen Shônin Gyôjô Ezu 法然上人行状絵図. Bildene kan tolkes som en referanse til Amidas 48 løfter om å hjelpe sine medskapninger i deres egen frigjøringsprosess. Bildene ble laget etter ønske av ex-keiser Go-Fushimi ca. år 1300 og er et mesterverk fra Kamakura-periodens kunst.